Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNX13Q9Y5W8 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX13Q9Y5W8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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