Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K6

CD2AP, CD2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD2APQ9Y5K6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CD2APQ9Y5K6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CD2APQ9Y5K6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms