Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y577

TRIM17, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM17, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM17Q9Y577 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM17Q9Y577 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM17Q9Y577 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM17Q9Y577 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM17Q9Y577 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms