Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
USP15Q9Y4E8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
USP15Q9Y4E8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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