Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
R3HCC1Q9Y3T6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms