Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ZNF330Q9Y3S2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNF330Q9Y3S2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms