Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAPPC4Q9Y296 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRAPPC4Q9Y296 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms