Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FARSAQ9Y285 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FARSAQ9Y285 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms