Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRPC6Q9Y210 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRPC6Q9Y210 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms