Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PHF8Q9UPP1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PHF8Q9UPP1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PHF8Q9UPP1 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms