Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
FZD4Q9ULV1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
FZD4Q9ULV1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms