Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ITGA11Q9UKX5 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ITGA11Q9UKX5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms