Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO4Q9UKT5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
FBXO4Q9UKT5 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms