Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MSRAQ9UJ68 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MSRAQ9UJ68 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms