Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
VAX2Q9UIW0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
VAX2Q9UIW0 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms