Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ATPIF1Q9UII2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATPIF1Q9UII2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms