Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MED13Q9UHV7 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
MED13Q9UHV7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13Q9UHV7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13Q9UHV7 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13Q9UHV7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13Q9UHV7 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MED13Q9UHV7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms