Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SRP68Q9UHB9 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SRP68Q9UHB9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms