Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FBXO40Q9UH90 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO40Q9UH90 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms