Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC59Q9P031 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC59Q9P031 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms