Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ARHGEF12Q9NZN5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ARHGEF12Q9NZN5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms