Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
GDE1Q9NZC3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GDE1Q9NZC3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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