Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RDH8Q9NYR8 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms