Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRMT1Q9NXH9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRMT1Q9NXH9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms