Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWW5

CLN6, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN6Q9NWW5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLN6Q9NWW5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLN6Q9NWW5 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms