Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH2

TMEM242, Transmembrane protein 242, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM242Q9NWH2 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TMEM242Q9NWH2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms