Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GINM1Q9NU53 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GINM1Q9NU53 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms