Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRC9

OTOR, Otoraplin, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTORQ9NRC9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OTORQ9NRC9 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms