Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD163L1Q9NR16 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD163L1Q9NR16 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms