Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ75

CASS4, Cas scaffolding protein family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASS4Q9NQ75 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CASS4Q9NQ75 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CASS4Q9NQ75 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms