Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPY3

CD93, Complement component C1q receptor, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD93Q9NPY3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD93Q9NPY3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD93Q9NPY3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD93Q9NPY3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD93Q9NPY3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD93Q9NPY3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CD93Q9NPY3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD93Q9NPY3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CD93Q9NPY3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CD93Q9NPY3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms