Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BRMS1Q9HCU9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
BRMS1Q9HCU9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms