Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ELP3Q9H9T3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ELP3Q9H9T3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms