Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TDRD3Q9H7E2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TDRD3Q9H7E2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms