Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNCQ9H7C4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNCQ9H7C4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms