Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNMDQ9H2S6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNMDQ9H2S6 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms