Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SDCBP2Q9H190 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SDCBP2Q9H190 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms