Protein–RNA interactions for Protein: Q9C030

TRIM6, Tripartite motif-containing protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM6Q9C030 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM6Q9C030 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM6Q9C030 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms