Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NMES1Q9C002 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms