Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SMIM3Q9BZL3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM3Q9BZL3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms