Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RSPO3Q9BXY4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RSPO3Q9BXY4 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms