Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TDRD1Q9BXT4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TDRD1Q9BXT4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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