Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TUBB2BQ9BVA1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TUBB2BQ9BVA1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms