Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTC8

MTA3, Metastasis-associated protein MTA3, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA3Q9BTC8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTA3Q9BTC8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTA3Q9BTC8 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms