Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TINF2Q9BSI4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms