Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMEM175Q9BSA9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM175Q9BSA9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms