Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TM2D3Q9BRN9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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TM2D3Q9BRN9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TM2D3Q9BRN9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TM2D3Q9BRN9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TM2D3Q9BRN9 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TM2D3Q9BRN9 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TM2D3Q9BRN9 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TM2D3Q9BRN9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TM2D3Q9BRN9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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