Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SEC22CQ9BRL7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms