Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ECSITQ9BQ95 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ECSITQ9BQ95 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms