Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CMSS1Q9BQ75 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CMSS1Q9BQ75 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms